biologyscienceТимирязевский биологический журналTimiryazev Biological Journal2949-4710ФГБОУ ВО РГАУ-МСХА имени К.А. Тимирязева (ФГБОУ ВО РГАУ-МСХА имени К.А. Тимирязева)10.26897/2949-4710-2023-1-35-45biologyscience-85Research ArticleФИЗИОЛОГИЯ РАСТЕНИЙ, МИКРОБИОЛОГИЯPLANT PHYSIOLOGY, MICROBIOLOGYОсобенности бактериальных сообществ почв разной степени засоленности на примере Шаульдерского массива орошения Туркестанской области Республики КазахстанFeatures of Soil Bacterial Communities of Varying Degree of Salinity on the Example of the Shaulder Irrigation Massif of the Turkestan Region of the Republic of Kazakhstanhttps://orcid.org/0000-0003-4846-6363СелицкаяО. В.SelitskayaO. V.

Ольга Валентиновна Селицкая, к.б.н., доцент, доцент кафедры микробиологии и иммунологии

127434, г. Москва, ул. Тимирязевская, д. 49

Olga V. Selitskaya, CSc (Bio), Associate Professor,Associate Professor of Department of Microbiology and Immunology, 

49 Timiryazevskaya Str., Moscow, 127434

oselitskaya@rgau-msha.ruhttps://orcid.org/0000-0002-8635-2909ИбраеваМ. А.IbraevaM. A.

Мария Аменовна Ибраева, к.с.-х.н., зав. отделом плодородия и биологии почв 

050060, г. Алматы, пр. Аль-Фараби, 75 В

Maria A. Ibraeva, CSc (Ag), Head of the Department of Soil Fertility and Biology

75 Al-Farabi Av., Almaty, 050060

ibraevamar@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0001-5473-9714ВаньковаА. А.VankovaA. A.

Анна Андреевна Ванькова, к.б.н., доцент, доцент кафедры микробиологии и иммунологии

127434, Россия, г. Москва, ул. Тимирязевская, д. 49

Anna A. Vankova, CSc (Bio), Associate Professor, Associate Professor of the Department of Microbiology and Immunology

49 Timiryazevskaya Str., Moscow, 127434

avankova@rgau-msha.ruhttps://orcid.org/0000-0003-3034-6566КозловА. В.KozlovA. V.

Андрей Владимирович Козлов, д.б.н., доцент, зав. кафедрой микробиологии и иммунологии ,

127434, Россия, г. Москва, ул. Тимирязевская, д. 49

Andrey V. Kozlov, DSc (Bio), Associate Professor, Head of the Department of Microbiology and Immunology

49 Timiryazevskaya Str., Moscow, 127434

a.kozlov@rgau-msha.ruРГАУ-МСХА имени К.А. ТимирязеваРоссияRussian State Agrarian University – Moscow Timiryazev Agricultural AcademyRussian FederationТОО «Казахский научноисследовательский институт почвоведения и агрохимии имени У.У. Успанова»КазахстанKazakh Research Institute of Soil Science and Agrochemistry named after U.U. UspanovKazakhstanРГАУ-МСХА имени К.А. ТимирязеваРоссияRussian State Agrarian University – Moscow Timiryazev Agricultural AcademyRussian Federation202320092023113545Copyright © Селицкая О.В., Ибраева М.А., Ванькова А.А., Козлов А.В., 20232023Селицкая О.В., Ибраева М.А., Ванькова А.А., Козлов А.В.Selitskaya O.V., Ibraeva M.A., Vankova A.A., Kozlov A.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.bioscience-journal.com/jour/article/view/85

 

Проведена сравнительная оценка бактериальных сообществ лугово-сероземной почвы разной степени засоления. Выявлены существенные различия в структуре микробиомов пахотных горизонтов слабозасоленной с очень сильнозасоленной лугово-сероземной почвы. Установлено значительное сокращение разнообразия микробиома на уровне филума при повышении степени засоления почв (на примере лугово-сероземных почв Шаульдерского массива орошения). Структура бактериальных сообществ лугово-сероземной очень сильзасоленной почвы представлена 4 филумами бактерий: Actinobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes, Proteobacteria, в то время как в слабозасоленной почве было выявлено 13 филумов бактерий (Proteobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes, Verrucomicrobia, Acidobacteria, Chloroflexi, Firmicutes, Gemmatimonadetes, Planctomycetes, Saccharibacteria, Cyanobacteria, Chlorobi, Nitrospirae). Согласно индексу Шеннона видовое разнообразие микробиома лугово-сероземных почв Шаульдерского массива орошения примерно на 20% выше на слабозасоленных почвах по сравнению с очень сильнозасоленными. Индекс Сhao1 и количество таксономических единиц (OТЕ) также указывают на снижение примерно в два раза α-разнообразия в микробиоме очень сильнозасоленной почвы. Подтверждена экологическая значимость проблемы вторичного засоления почв. С повышением содержания солей в почвах видовое разнообразие бактериального сообщества сокращается, что можно считать одним из показателей деградации почвы.

A comparative assessment of bacterial communities of meadow-serozem soils of different degrees of salinity was carried out. Significant differences in the structure of microbiomes of arable horizons of weakly saline and highly saline meadow-serozem soil were revealed. A significant reduction in the diversity of the microbiome at the phylum level with an increase in the level of soil salinity was established (on the example of meadow-serozem soils of the Shaulder irrigation massif). The structure of bacterial communities of the meadow-serozem highly saline soil is represented by four bacterial phyla: (Actinobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes, Proteobacteria), while 13 bacterial phyla were identified in weakly salinized soil (Proteobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes, Verrucomicrobia, Acidobacteria, Chloroflexi, Firmicutes, Gemmatimonadetes, Planctomycetes, Saccharibacteria, Cyanobacteria, Chlorobi, Nitrospirae). According to the Shannon index, the species diversity of the microbiome of the meadow-serozem soils of the Shaulder irrigation massif is about 20% higher on weakly saline soils compared to highly saline ones. The Chao1 index and the number of taxonomic units (OTUs) also indicate a roughly halving of alpha diversity in the highly saline soil microbiome. The ecological significance of the problem of secondary soil salinization was confirmed. With an increase of salt content in soils, the species diversity of the bacterial community decreases, which can be considered as one of the indicators of soil degradation.

бактериальные сообщества почвмикробиомбиоразнообразиезасоленные почвыаридные территорииШаульдерский массив орошенияКазахстанsoil bacterial communitiesmicrobiomebiodiversitysaline soilsarid territoriesthe Shaulder irrigation massifKazakhstanReferencesАндронов Е.Е., Петров С.Н., Пинаев А.Г., Першина Е.В., Рахимгалиева С.Ж., Ахмеденов К.М., Горобец А.В., Сергалиев Н.Х. Изучение структуры микробного сообщества почв разной степени засоления с использованием T-RFLP и ПЦР с детекцией в реальном времени // Почвоведение. – 2012. – № 2. – С. 173–183.Andronov E.E., Petrov S.N., Pinaev A.G., Pershina E.V., S.ZH. Rahimgalieva K.M. Ahmedenov, Gorobets A.V., Sergaliev N.Kh. Izuchenie struktury mikrobnogo soobshchestva pochv raznoy stepeni zasoleniya s ispol’zovaniem T-RFLP i PTsR s detektsiey v real’nom vremeni [Studying the microbial community structure of soils of different salinity levels using T-RFLP and real-time PCR]. Pochvovedenie. 2012;Базилевич Н.И., Панкова Е.И. Опыт классификации почв по содержанию токсичных солей и ионов // Бюллетень Почвенного института им. В.В. Докучаева. – 1972. – Вып. 5. – С. 36–40.: 173–183. (In Rus.). 2. Bazilevich N.I., Pankova E.I. Opyt klassifikatsii pochv po soderzhaniyu toksichnykh soley i ionov [Experience in classifying soils by toxic salt and ion content]. Byul. Pochv. in-ta im. V.V. Dokuchaeva. 1972;5:36–40. (In Rus.).Галиев В.В., Цырульников А.О. Сравнение методов выделения метагеномной ДНК из образцов почвы // Вестник НГПУ. – 2011. – № 1. – С. 75–84.Galiev V.V., Tsyrul’nikov A.O. Sravnenie metodov vydeleniya metagenomnoy DNK iz obraztsov pochvy [Comparison of methods for the isolation of metagenomic DNA from soil samples]. Vestnik NGPU. 2011;1:75–84. (In Rus.).Глазовский Н.Ф. Аральский кризис: Причины возникновения и пути выхода // Наука. – 1990. – 136 с.Glazovskiy N.F. Aral’skiy krizis: Prichiny vozniknoveniya i puti vykhoda [The Aral Sea crisis: Causes and solutions]. Nauka, 1990: 136. (In Rus.).ГОСТ Р 58595–2019. Почвы. Отбор проб. – Москва: Стандартинформ, 2019. – 6 с.GOST R58595–2019 Pochvy. Otbor prob. [GOST R58595–2019 Soils. Sampling. Moscow: Standartinform. 2019: 6. (In Rus.).Гришко В.Н., Сыщикова О.В., Зенова Г.М., Кожевин П.А., Дуброва М.С., Лубсанова Д.А., Чернов И.Ю. Мицелиальные актинобактерии засоленных почв аридных территорий Украины и России // Почвоведение. – 2015. – № 1. – С. 81–86.Grishko V.N., Syshchikova O.V., Zenova G.M., Kozhevin P.A., Dubrova Lubsanova M.S., D.A., Chernov I.Yu. Mitselial’nye aktinobakterii zasolennykh pochv aridnykh territoriy Ukrainy i Rossii [Mycelial actinobacteria of saline soils in arid areas of Ukraine and Russia]. Pochvovedenie. 2015; 1: 81–86. (In Rus.).Добровольская Т.Г., Звягинцев Д.Г., Чернов И.Ю., Головченко А.В., Зенова Г.М., Лысак Л.В., Манучарова Н.А., Марфенина О.Е., Полянская Л.М., Степанов А.Л., Умаров М.М. Роль микроорганизмов в экологических функциях почв // Почвоведение. – 2015. – № 9. – 1087 с.Dobrovol’skaya T.G., Zvyagintsev D.G., Chernov I.Yu., Golovchenko A.V., Zenova G.M., Lysak L.V., Manucharova N.A., Marfenina O.E., Polyanskaya L.M., Stepanov A.L., Umarov M.M. Rol’ mikroorganizmov v ekologicheskikh funktsiyakh pochv [The role of micro-organisms in the ecological functions of soils]. Pochvovedenie. 2015; 9: 1087. (In Rus.).Дурасов А.М., Тазабеков Т.Т. Почвы Казахстана: Коллективная монография. – Алма-Ата: Кайнар, 1981. – 152 с.Durasov A.M., Tazabekov T.T. Pochvy Kazahstana: Kollektivnaya monografiya. [Soils of Kazakhstan: collective monograph]. Alma-Ata, Kaynar, 1981: 152. (In Rus.).Звягинцев Д.Г., Зенова Г.М. Экология актиномицетов. – М.: Изд-во ГЕОС, 2001. – 256 с.Zvyagintsev D.G., Zenova G.M. Ekologiya aktinomitsetov [Ecology of actinomycetes]. M.: Izd-vo GEOS, 2001: 256. (In Rus.).Зенова Г.М., Манучаров А.С., Грачева Т.А., Степанова О.А., Звягинцев Д.Г. Экологические особенности актиномицетных комплексов засоленных почв // Почвоведение – продовольственной и экологической безопасности страны: Тезисы докладов VII съезда Общества почвоведов им. В.В. Докучаева и Всероссийской с международным участием научной конференции. – 2016. – С. 222–223.Zenova G.M., Manucharov A.S., Gracheva T.A., Stepanova O.A., Zvyagintsev D.G. Ekologicheskie osobennosti aktinomitsetnykh kompleksov zasolennykh pochv [Ecological features of actinomycete complexes in saline soils]. Pochvovedenie – prodovol’stvennoy i ekologicheskoy bezopasnosti strany. Tezisy dokladov VII s”ezda Obshchestva pochvovedov im. V.V. Dokuchaeva i Vserossiyskot s mezhdunarodnym uchastiem nauchnoy konferentsii. 2016: 222–223. (In Rus.).Зенова Г.М., Звягинцев Д.Г., Манучарова Н.А., Степанова О.А., Чернов И.Ю. Актиномицетный комплекс светлого серозема предгорий Копетдага // Почвоведение. – 2016. – № 10. – С. 1214–1217. doi: 10.7868/S0032180X16100166.Zenova G.M., Zvyagintsev D.G., Manucharova N.A., Stepanova O.A., Chernov I.Yu. Aktinomitsetnyy kompleks svetlogo serozema predgoriy Kopetdaga [Actinomycete complex of the light grey soil of the Kopetdag foothills]. Pochvovedenie. 2016; 10: 1214–1217. doi: 10.7868/S0032180X16100166 (In Rus.).Зенова Г.М., Дуброва М.С., Грачева Т.А., Кузнецова А.И., Степанова О.А., Чернов И.Ю., Манучаров А.С. Актиномицетные комплексы почв Приэльтонья // Вестник Московского университета. Серия 17 «Почвоведение». – 2016. – № 4. – С. 43–46.Zenova G.M., Dubrova M.S., Gracheva T.A., Kuznetsova A.I., Stepanova O.A., Chernov I.Yu., Manucharov A.S. Aktinomitsetnye kompleksy pochv Priel’ton’ya [Actinomycete complexes of the soils of the Elton region]. Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya 17. Pochvovedenie. 2016; 4: 43–46. (In Rus.).Зенова Г.М., Кожевин П.А., Манучарова Н.А., Лубсанова Д.А., Дуброва М.С. Экофизиологические особенности актиномицетов пустынных почв Монголии // Известия Российской академии наук. Серия биологическая. – 2014. – № 3. – С. 246.Zenova G.M., Kozhevin P.A., Manucharova N.A., Lubsanova D.A., Dubrova M.S. Ekofiziologicheskie osobennosti aktinomitsetov pustynnykh pochv Mongolii [Ecophysiological features of actinomycetes of desert soils in Mongolia]. Izvestiya Rossiyskoy akademii nauk. Seriya biologicheskaya. 2014; 3: 246. (In Rus.).Ибраева М.А., Отаров А., Дуйсеков С., Бейсенова Г., Сулейменова А., Пошанов М. Оценка основных показателей плодородия почв средней части Шаульдерского массива орошения по результатам почвенноагрохимической съемки // Почвоведение и агрохимия. – 2019. – № 2. – С. 30–45.Ibraeva M., Otarov A., Duysekov S., Beysenova G., Suleymenova A., Poshanov M. Otsenka osnovnykh pokazateley plodorodiya pochv sredney chasti Shaul’derskogo massiva orosheniya po rezul’tatam pochvennoagrokhimicheskoy s”emki [Assessment of the main soil fertility indicators of the middle part of the Shauldera irrigation massif based on the results of a soil-agrochemical survey]. Pochvovedenie i agrokhimiya. 2019; 2: 30–45. (In Rus.).Лебедева М.П., Конюшкова М.В. Временные изменения микропризнаков в целинных и мелиорированных солонцах Джаныбекского стационара // Почвоведение. – 2011. – № 7. – С. 818–831.Lebedeva M.P., Konyushkova M.V. Vremennye izmeneniya mikropriznakov v tselinnykh i meliorirovannykh solontsakh Dzhanybekskogo statsionara [Temporal changes in micro-signs in virgin and reclaimed solonchaks in the Dzhanybek stationary area]. Pochvovedenie #7. 2011: 818–831. (In Rus.).Лубсанова Д.А., Зенова Г.М., Кожевин П.А., Манучарова Н.А., Шваров А.П. Мицелиальные актинобактерии засоленных почв аридных территорий // Вестник Московского университета. – 2014. – № 2. – С. 44–48. doi: 10.3103/S0147687414020057.Lubsanova D.A., Zenova G.M., Ko zhevin P.A., Manucharova N.A., Shvarov A.P. Mitselial’nye aktinobakterii zasolennykh pochv aridnykh territoriy [Mycelial actinobacteria of saline soils in arid areas]. Vestnik Moskovskogo universiteta. 2014; 2: 44–48. doi: 10.3103/S0147687414020057 (In Rus.).Международное информационное агентство «КазИнформ». – www.inform.kz.Mezhdunarodnoe informatsionnoe agentstvo “KazInform”. [Electronic source]. URL: http://www.inform.kz (In Rus.).Мэгарран Э. Экологическое разнообразие и его измерение. – М.: Мир, 1992. – 184 с.Megarran E. Ekologicheskoe raznoobrazie i ego izmerenie [Ecological diversity and its measurement]. M.: Mir, 1992: 184. (In Rus.).Никитин Д.А., Семенов М.В., Чернов Т.И., Ксенофонтова Н.А., Железова А.Д., Иванова Е.А., Хитров Н.Б., Степанов А.Л. Микробиологические индикаторы экологических функций почв (обзор) // Почвоведение. – 2022. – № 2. – C. 228–243. doi: 10.31857/S0032180X22020095Nikitin D.A., Semenov M.V., Chernov T.I., Ksenofontova N.A., Zhelezova A.D., Ivanova E.A., Khitrov N.B., Stepanov A.L. Mikrobiologicheskie indikatory ekologicheskikh funktsiy pochv (obzor) [Microbiological indicators of soil ecological functions (overview)]. Pochvovedenie. 2022; 2: 228–243. doi: 10.31857/S0032180X22020095 (In Rus.).Отаров А., Ибраева М.А., Усипбеков М., Wilkomirski B., Suska-Malawska M. Краткая характеристика почвенного покрова и анализ современного состояния плодородия почв Южно-Казахстанской области // Почвоведение и агрохимия. – 2008. – С. 70–76.Otarov A., Ibraeva M.A., Usipbekov M., Wilkomirski B., Suska-Malawska M. Kratkaya kharakteristika pochvennogo pokrova i analiz sovremennogo sostoyaniya plodorodiya pochv Yuzhno-Kazahstanskoy oblasti [Brief characterisation of the soil cover and analysis of the current state of soil fertility in South Kazakhstan Oblast]. Pochvovedenie i agrokhimiya. 2008: 70–76. (In Rus.).Першина Е.В., Тамазян Г.С., Дольник А.С., Пинаев А.Г., Сергалиев Н.Х., Андронов Е.Е. Изучение структуры микробного сообщества засоленных почв с использованием высокопроизводительного секвенирования // Экологическая генетика. – 2012. – Т. 10, № 2. – С. 32–40.Pershina E.V., Tamazyan G.S., Dol’nik A.S., Pinaev A.G., Sergaliev N.H., Andronov E.E. Izuchenie struktury mikrobnogo soobshchestva zasolennykh pochv s ispol’zovaniem vysokoproizvoditel’nogo sekvenirovaniya [Studying the microbial community structure of saline soils using high-throughput sequencing]. Ekologicheskaya genetika. 2012; 10 (2): 32–40. (In Rus.).Равин Н.В., Марданов А.В., Скрябин К.Г. Метагеномика как инструмент изучения «некультивируемых» микроорганизмов // Генетика. – 2015. – № 5. – С. 519–626. doi: 10.7868/S0016675815050069.Ravin N.V., Mardanov A.V., Skryabin K.G. Metagenomika kak instrument izucheniya “nekul’tiviruemykh” mikroorganizmov [Metagenomics as a tool for the study of ‘unculturable’ micro-organisms]. Genetika #5. 2015: 519–626. doi: 10.7868/S0016675815050069 (In Rus.).Савин И.Ю., Отаров А.В., Жоголев А.В., Ибраева М.А., Дуйсеков С. Выявление многолетних изменений площади засоленных почв Шаульдерского орошаемого массива по космическим снимкам Landsat // Бюллетень Почвенного института имени В.В. Докучаева. – 2014. – № 74. – С. 49–65. doi: 10.19 047/0136–1694–2014–74–49–65.Savin I.Yu., Otarov A.V., Zhogolev A.V., Ibraeva M.A., Duysekov S. Vyyavlenie mnogoletnikh izmeneniy ploshchadi zasolennykh pochv Shaul’derskogo oroshaemogo massiva po kosmicheskim snimkam Landsat [Identifying multi-year changes in the area of saline soils in the Shauldera irrigated area using Landsat satellite images]. Byulleten’ Pochvennogo instituta imeni V.V. Dokuchaeva. 2014; 74: 49–65. doi: 10.19047/ 0136–1694–2014–74–49–65 (In Rus.).Семенов М.В., Чернов М.В., Семенов Т.И., Железова А.Д., Никитин Д.А., Тхакахова А.К., Иванова Е.А., Ксенофонтова Н.А., Сычева С.А., Колганова Т.В., Кутовая О.В. Микробные сообщества межледниковых и интерстадиальных палеопочв позднего плейстоцена // Почвоведение. – 2020. – № 6. – С. 716–725. doi: 10.31857/S0032180X20060106.Semenov M.V., Chernov M.V., Semenov T.I., Zhelezova A.D., Nikitin D.A., Tkhakakhova A.K., Ivanova E.A., Ksenofontova N.A., Sycheva S.A., Kolganova T.V., Kutovaya O.V. Mikrobnye soobshchestva mezhlednikovykh i interstadial’nykh paleopochv pozdnego pleystotsena [Microbial communities of Late Pleistocene interglacial and interstadial palaeo-soils]. Pochvovedenie. 2020; 6: 716–725. doi: 10.31857/S0032180X20060106 (In Rus.).Тихонович И.А., Чернов А.Д., Железова А.К., Тхакахова Е.Е., Андронов О.В., Кутовая Т.И. Таксономическая структура прокариотных сообществ почв разных биоклиматических зон // Бюллетень Почвенного института им. В.В. Докучаева. – 2018. – № 95. – С. 125–153. doi: 10.19047/ 0136–1694–2018–95–125–153.Tikhonovich I.A., Chernov T.I., Zhelezova A.D., Tkha ka khova A.K., Andronov E.E., Kutovaya O.V. Taksonomicheskaya struktura prokariotnykh soobshchestv pochv raznykh bioklimaticheskikh zon [Taxonomic structure of prokaryotic communities of soils in different bioclimatic zones]. Byulleten’ Pochvennogo instituta im. V.V. Dokuchaeva. 2018; 95: 125–153. doi: 10.19047/0136–1694–2018–95–125–153 (In Rus.).Токсеитова Г.А. Характеристика микростроения естественных и орошаемых лугово-сероземных почв юго-востока Казахстана // Почвоведение и агрохимия. – 2013. – С. 86–91.Tokseitova G.A. Kharakteristika mikrostroeniya estestvennykh i oroshaemykh lugovo-serozemnykh pochv yugo-vostoka Kazakhstana [Characteristics of the microstructure of natural and irrigated meadow-sierozem soils in south-east Kazakhstan]. Pochvovedenie i agrokhimiya. 2013: 86–91. (In Rus.).Чернов Т.И., Тхакахова А.К., Кутовая О.В. Оценка различных индексов разнообразия для характеристики почвенного прокариотного сообщества по данным метагеномного анализа // Почвоведение. – 2015. – С. 462–468.Chernov T.I., Tkhakakhova A K., Kutovaya O.V. Otsenka razlichnykh indeksov raznoobraziya dlya kharakteristiki pochvennogo prokariotnogo soobshchestva po dannym metagenomnogo analiza [Assessment of different diversity indices to characterise the soil prokaryotic community by metagenomic analysis]. Pochvovedenie. 2015: 462–468. (In Rus.).Чернов Т.И., Лебедева М.П., Тхакахова А.К., Кутовая О.В. Профильный анализ микробиомов сопряженных почв солонцового комплекса Прикаспийской низменности // Почвоведение. – 2017. – № 1. – С. 71–76. doi:10.7868/S0032180X1701004X.Chernov T.I., Lebedeva M.P., Tkhakakhova A.K., Kutovaya O.V. Profil’nyy analiz mikrobiomov sopryazhennykh pochv solontsovogo kompleksa Prikaspiyskoy nizmennosti [Profile analysis of microbiomes of conjugated soils of the solonetz complex of the Caspian lowland]. Pochvovedenie. 2017; 1: 71–76. doi:10.7868/S0032180X1701004X (In Rus.).Чернов Т.И., Тхакахова А.К., Лебедева М.П., Железова А.Д., Бгажба Н.А., Кутовая О.В. Микробиомы контрастных по засолению почв солонцового комплекса Волго-Уральского междуречья // Почвоведение. – 2018. – № 9. – C. 1115–1124. doi: 10.1134/S0032180X18090046.Chernov T.I., Tkhakakhova A.K., Lebedeva M.P., Zhelezova A.D., Bgazhba N.A., Kutovaya O.V. Mikrobiomy kontrastnykh po zasoleniyu pochv solontsovogo kompleksa Volgo-Ural’skogo mezhdurech’ya [Microbiomes of salinity contrasting soils of the Volga-Ural interfluves complex]. Pochvovedenie. 2018; 9: 1115–1124. doi: 10.1134/ S0032180X18090046 (In Rus.).Чернов Т.И., Железова А.Д., Кутовая О.В., Макеев А.О., Тхакахова А.К., Бгажба Н.А., Курбанова Ф.Г., Русаков А.В., Пузанова Т.А., Хохлова О.С. Сравнительная оценка структуры микробиомов погребенных и современных почв при помощи анализа микробной ДНК / Т.И. Чернов, // Микробиология. – 2018. – Т. 87, № 6. – С. 737–746. doi: 10.1134/ S0026365618060071.Chernov T.I., Zhelezova A.D., Kutovaya O.V., Makeev A.O., Tkhakakhova A.K., Bgazhba N.A., Kurbanova F.G., Rusakov A.V., Puzanova T.A., Khokhlova O.S. Sravnitel’naya otsenka struktury mikrobiomov pogrebennykh i sovremennykh pochv pri pomoshchi analiza mikrobnoy DNK [Comparative assessment of the microbiome structure of buried and modern soils by microbial DNA analysis]. Mikrobiologiya. 2018; 87 (6): 737–746. doi: 10.1134/ S0026365618060071 (In Rus.).Экологические проблемы стран Азии и Африки / Под ред. Д.В. Стрельцова, Р.А. Алиева. – М.: Аспект Пресс, 2012. – 271 с.Ekologicheskie problemy gosudarstv Sredney Azii i Kazahstana [Electronic source]. URL: otherreferats.allbest.ru/ecology/00162789_0.html (Access date: 15.05.2020) (In Rus.).Balvanera P., Pfisterer A.B., Buchmann N., He J.S., Nakashizuka T., Raffaelli D., Schmid B. Quantifying the evidence for biodiversity effects on ecosystem functioning and services // Ecol Lett. – 2006. – № 9. – Pp. 1146–1156.Balvanera P., Pfisterer A.B, Buchmann N, He J-S, Nakashizuka T, Raffaelli D, Schmid B. Quantifying the evidence for biodiversity effects on ecosystem functioning and services. Ecol Lett. 2006 Oct; 9(10): 1146–1156.Blume E., Bischoff M., Reichert J., Moorman T., Konopka A., Turco R. Surface and subsurface microbial biomass, community structure and metabolic activity as a function of soil depth and season // Applied Soil Ecology. – 2002. – V. 20. – № 3. – Pp. 171–181.Blume E., Bischoff M., Reichert J., Moorman T., Konopka A., Turco R. Surface and subsurface microbial biomass, community structure and metabolic activity as a function of soil depth and season. Applied Soil Ecology. 2002; 20 (3): 171–181.Castro H.F., Classen A.T., Austin E.E., Norby R.J., Schadt C.W. Soil microbial community responses to multiple experimental climate change drivers // Applied and Environmental Microbiology. – 2010. – V. 76, № 4. – Pp. 999–1007. doi: 10.1007/ s00248–004–0211–7.Castro H.F., Classen A.T., Austin E.E., Norby R.J., Schadt C.W. Soil microbial community responses to multiple experimental climate change drivers. Applied and Environmental Microbiology. 2010; 76 (4): 999–1007. doi: 10.1007/s00248–004–0211–7.Chao A. Nonparametric estimation of the number of classes in a population // Scandinavian Journal of Statistics. – 1984. – V. 11. – Pp. 265–270. doi:10.2307/4615964.Chao A. Nonparametric estimation of the number of classes in a population. Scandinavian Journal of Statistics. 1984; 11: 265–270. doi:10.2307/4615964.Clementino M.M., Vieira R.P., Cardoso A.M., Ventosa A., Martins O.B. Prokaryotic diversity in one of the largest hypersaline coastal lagoons in the world // Extremophiles. – 2008. – 12 (4). – Pp. 595–604. doi:10.1007/s00792–008–0162-x.Clementino M.M., Vieira R.P., Cardoso A.M., Ventosa A., Martins O.B. Prokaryotic diversity in one of the largest hypersaline coastal lagoons in the world. Extremophiles. 2008; 12(4): 595–604. doi:10.1007/s00792–008–0162-x.Forney L.J., Zhou X., Brown C.J. Molecular microbial ecology: land of the one-eyed king // Current Opinion in Microbiology. – 2004. – V. 7. – № 3. – Pp. 210–220. doi: 10.1016/j.mib.2004.04.015.Forney L.J., Zhou X., Brown C.J. Molecular microbial ecology: land of the one-eyed king. Current Opinion in Microbiology. 2004; 7 (3): 210–220. doi: 10.1016/j.mib.2004.04.015.Jeffery S., Gardi C. Soil biodiversity under threat – a review // Acta Societatis Zoologicae Bohemicae. České Budějovice. – 2010. – V. 74 (1–2). – Pp. 7–12.Jeffery S., Gardi C. Soil biodiversity under threat – a review. Acta Societatis Zoologicae Bohemicae. České Budějovice. 2010; 74(1–2): 7–12.Garrity G.M., Bell J.A., Lilburn T. Class III. Gammaproteobacteria class. nov. // Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. – 2005. – Vol. 2. – P. 1.Garrity G.M, Bell J.A., Lilburn T. Class III. Gammaproteobacteria class“. nov. Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. 2005; 2: 1.Gilbert J.A., Dupont C.L. Microbial Metagenomics: Beyond the Genome // Annual Review of Marine Science. – 2011. – V. 3 – Pp. 347–371. doi: 10.1146/annurev-marine-120709–142811Gilbert J.A., Dupont C.L. Microbial Metagenomics: Beyond the Genome. Annual Review of Marine Science. 2011; 3: 347–371. doi: 10.1146/annurev-marine-120709–142811.IUSS Working Group WRB. World Reference Base for Soil Resources 2014: International soil classification system for naming soils and creating legends for soil maps. World Soil Resources Reports 106. – FAO, Rome, 2014. – 181 p.IUSS Working Group WRB. World Reference Base for Soil Resources 2014: International soil classification system for naming soils and creating legends for soil maps. World Soil Resources Reports № . 106. FAO, Rome, 2014: 181.Lombard N., Prestat E., Elsas J.D.V., Simonet P. Soil-specific limitations for access and analysis of soil microbial communities by metagenomics // FEMS Microbiology Ecology. – 2011. – V. 78, № 1. – Pp. 31–49. doi: 10.1111/j.1574–6941.2011.01140.x.Lombard N., Prestat E., van Elsas J.D., Simonet P. Soil-specific limitations for access and analysis of soil microbial communities by metagenomics. FEMS Microbiology Ecology. 2011; 78 (1): 31–49. doi: 10.1111/j.1574–6941.2011.01140.x.Reed H.E., Martiny J.B.H. Testing the functional significance of microbial composition in natural communities // FEMS Microbiol. Ecol. – 2007. – V. 62. – Pp. 161–170. doi: 10.1111/j.1574–6941.2007.00386.x.Reed H.E., Martiny J.B.H. Testing the functional significance of microbial composition in natural communities. FEMS Microbiol Ecol. 2007; 62: 161–170. doi: 10.1111/j.1574–6941.2007.00386.x.Scott K.M., Sievert S., Abril F., Ball L., Barrett C., et al. The genome of deep-sea vent chemolithoautotroph Thiomicrospira crunogena XCL-2 // PLoS Biol. – 2006. – V. 4. – 383 p.Scott K.M., Sievert S., Abril F., Ball L., Barrett C., et al. The genome of deep-sea vent chemolithoautotroph Thiomicrospira crunogena XCL-2. PLoS Biol. 2006; 4: 383.Bardgett R.D. The unseen majority: soil microbes as drivers of plant diversity and productivity in terrestrial ecosystems // Ecol. Lett. – 2008. – V. 11. – Pp. 296–310. doi.org/10.1111/j.1461–0248.200 7.01139.x.Bardgett R.D. The unseen majority: soil microbes as drivers of plant diversity and productivity in terrestrial ecosystems. Ecol Lett. 2008; 11: 296–310. doi.org/10.1111/j.1461–0248.2007.01139.x.Ventosa A., Mellado E., Sanchez-Porro C., Marquez Halophilic C. and halotolerant microorganisms from soils // Microbiology of Extreme Soils. – 2008. – Pp. 87–115. doi:10.1007/978–3–540–74231–9_5.Ventosa A., Mellado E., Sanchez-Porro C., Marquez C. Halophilic and halotolerant microorganisms from soils. Microbiology of Extreme Soils. 2008: 87–115. doi:10.1007/978–3–540–74231–9_5Vera-Gargallo В., Chowdhury B., Brown T.R., Jansson J., Ventosa J.K. Spatial distribution of prokaryotic communities in hypersaline soils // Scientific Reports. – 2019. – V. 9 (1). doi:10.1038/s41598–018–38339-z.Vera-Gargallo V., Chowdhury B., Brown T.R., Jansson J., Ventosa J.K. Spatial distribution of prokaryotic communities in hypersaline soils / V. Vera-Gargallo // Scientific Reports. 2019; 9(1). doi:10.1038/s41598–018–38339-z.Williams K.P., Kelly P., Joseph J., Bruno W. et. аl.Phylogeny of Gammaproteobacteria // Dickerman Journal of Bacteriology. – 2010. – № 9. – V. 192. doi: 10.1128/JB.01480–09.Williams K.P., Kelly P., Joseph J., Bruno W., et al. Phylogeny of Gammaproteobacteria. Dickerman Journal of Bacteriology. 2010; 192 (9). doi: 10.1128/JB.01480–09.Wang Q., Garrity G., Tiedje J., Cole J. Naïve Bayesian Classifier for Rapid Assignment of rRNA Sequences into the New Bacterial taxonomy // Appl. Environ. Microbiol. – 2007. – 73 (16). – Pp. 5261–5267.Wang Q., Garrity G., Tiedje J., Cole J. Naïve Bayesian Classifier for Rapid Assignment of rRNA Sequences into the New Bacterial taxonomy. Appl Environ Microbiol. 2007; 73(16): 5261–5267.Wooley J., Ye Y. Metagenomics: Facts and artifacts, and computation challenges // Journal of computer Science and Technology. – 2009. – V. 1 (25). – Pp. 71–81. doi 10.1007/s11390–010–9306–4.Wooley J., Ye Y. Metagenomics: Facts and artifacts, and computation challenges. Journal of computer Science and Technology. 2009; 1(25): 71–81. doi 10.1007/s11390–010–9306–4.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.